種雞粒線體基因條碼
張秀鑾 陳婉婷
國立屏東科技大學畜產系
雞隻廣泛地分佈於全球,其主要提供人類食物來源與觀賞用途;故人類文化對其馴化過程有著重要的影響。綜觀鷄隻馴養史,除了提供食物來源外,常隨著不同目的而育種;如長鳴鷄與鬥雞即為典型的例子,故其為研究選育與人類文化關係之良好選擇。例如:在日本17個本土鷄品系中,有三個可依外表型區分的長鳴鷄種,Koeyoshi,
Totenko與Tomaru。經粒線體DNA
(Mitochondria DNA, mtDNA) D-loop序列分析與親源樹狀圖評估後發現,前三者均屬同一家系且源自名為Shamo的鬥雞家系;該鷄種依地緣上,應係屬南中國與印度支那(而非日本本土)之鬥雞,隨後在日本因人類喜好而逐漸選育成具長鳴特性之鷄種。
1977年Carl
Woese首次大量應用單一基因上核苷酸序列之差異探討演化關係,隨著愈來愈多的生物體rRNA序列比較結果的出爐,終於締造生命樹重繪的機會。近年來,結合PCR技術的發展,進一步提供基因序列差異檢測的方便性。在親源相近的生物體,演化緩慢的基因(如rRNA)通常是沒有差異的;但其為建立原始古老關係所不可或缺的,因其可追溯至細胞生命的起源。相反地,演化速率快的基因可能重寫與覆蓋了古代生物間之類同足跡,故經常能顯現出相近物種間的分歧;此即為mtDNA能被廣泛地用於動物類源研究之主因。粒線體DNA因其構造特殊,不僅缺乏組織蛋白(histone)保護且DNA修護系統效率不彰;導致高突變率(high
mutation rate)的產生。同時,因其具高突變固定率(high mutation fixation rate),故演化速率遠較核內DNA為快,故即使在相近物種間亦可累積差異可供辨識。